Auf kantonaler Ebene weist das politische System die gleichen Strukturen auf, wie auf Bundesebene. Auch hier gilt die Unterscheidung in:
Legislature (legislative power): Cantonal Council
Executive (executive power): Government Council
Judiciary (judicial power): Cantonal Court
Die wichtigsten Parteien im Kanton sind die Schweizerische Volkspartei (SVP), die Mitte, die Liberalen (FDP), die Christlichsoziale Partei Obwalden (CSP OW) und die Sozialdemokratische Partei Obwalden (SP).